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納濾和反滲透膜的性能主要由水通量(透過速度)和脫鹽率(分離效果)來決定。水通量和脫鹽率通常受操作壓力、濃度、溫度、流量、pH值等幾點因素的影響。
操作壓力的影響
水通量的增加與壓力成正比。理論上說，如果為了得到足夠產水量，在不增加膜面積的情況下，只需要增加進水的壓力即可。但是在實際的運行中，這必然帶來能源的大量消耗。因此，選擇適當的膜元件數量才是經濟實惠的選擇。
給水流量的影響
給水流量對產水量和脫鹽率同樣存在影響，只是這種影響比較緩和，并不劇烈。隨著給水流量的增加，膜表面的流速也增大了，這使得壓力隨之增大，同時由于流速的升高減少了膜表面的濃差極化，從而提高了脫鹽率。
給水含鹽量的影響
在一定的壓力下，當給水中的含鹽量增高時產水量就會減少，這是因為給水的滲透壓變高，有效壓力隨之降低的緣故。脫鹽率受含鹽量影響也非常大，對于除海水淡化膜以外的反滲透膜來說，通常當含鹽量增高時脫鹽率會下降。當進水含鹽量在非常低的一個范圍時，隨著含鹽量的增加，脫鹽率會稍許增加。海水淡化反滲透膜元件不同，由于海水淡化反滲透膜更加致密，在給水含鹽量高時，脫鹽率會下降得非常緩慢。
溫度的影響
溫度對脫鹽率和產水量的影響非常大。對全部類型的反滲透膜元件來說，當溫度升高時，由于水的粘度降低，產水量也隨之增加。通常在相同的壓力下，溫度每上升或下降1℃，產水量可增大或降低3-4%。另一方面溫度對于脫鹽率的影響根據膜材質的不同而表現的大相徑庭。這是由于當溫度上升時，鹽的擴散速度就會增大。
回收率
回收率是指產水量和進水流量的比值。在壓力一定時，回收率提高，膜表面的濃差極化現象也更加嚴重，有效壓力則相對減小，這導致產水量下降，脫鹽率降低。反滲透系統在設計和調試時，選擇回收率的確定與原水水質密切相關。回收率增高，溶解于溶液中的鹽會更加接近飽和狀態，有可能析出后在膜表面沉淀并結垢，會對膜性能帶來很大的危害。
pH值的影響
pH值對納濾和反滲透膜元件的影響有兩個方面，第一：正常運行時對脫鹽率的影響:第二：清洗時不同pH值的清洗效果以及清洗時pH值的范圍。通常來說，正常運行時的pH值應該接近中性，即pH值7左右。這是由兩個因素決定的，反滲透膜在pH值7.5 - 7.8時脫鹽率最高。總之，過高或過低的PH值會加速膜元件分離層的老化，降低膜元件的壽命。
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